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Genomas defectivos SARS-CoV-2

Nota de Premsa – 03/03/2023

El grupo de investigación del Vall d’Hebron Institut de Recerca liderado por el Dr. Josep Quer en colaboración con el grupo de virus respiratorios liderados por el Dr. Andrés Antón, descubren un mecanismo de evolución que utiliza el SARS-CoV-2 que le permite ser más transmisible. Estudiando las variantes desde el principio de la pandemia hasta hoy en día y centrándose en las variantes que han dominado cada una de la olas pandémicas. El equipo ha encontrado que, durante 2020, cuando la población humana carecía de memoria inmune contra SARS-CoV-2, las variantes mayoritarias generaban genomas defectivos. Estos genomas defectivos se ha publicado que atenúan la severidad de la infección. A principios de 2021, en una situación epidemiológica diferente puesto que una parte importante de la población había superado la infección o había recibido varias dosis vacunal y por tanto se contaba con una memoria inmunológica, las variantes que se seleccionaron Alpha, Beta y Delta dejaron de producir genomas defectivos, lo cual, defienden los investigadores, que les dio una ventaja para transmitirse más fácilmente en una situación en que la memoria inmune protegía de sufrir una infección grave.

Lo más sorprendente, fue comprobar que las primeras variantes de Omicron que desplazaron completamente a Delta (finales de 2021), volvían a presentar genomas defectivos. Esto refuerza los trabajos publicados de que Omicron no es una evolución desde Delta, sino que se parece más a las variantes de Junio/Julio de 2020 al inicio de la pandemia. La explicación que discuten los investigadores, es que Omicron se impuso a Delta por las 50-60 mutaciones que presenta a lo largo de su genoma y que le permiten concentrar la infección en el tracto respiratorio superior (nariz/cuello), de manera que se puede transmitir simplemente hablando o con una tos muy suave a diferencia de Alpha, Beta, Delta que infectaban tanto tracto respiratorio superior como inferior (pulmón). Este trabajo ha sido publicado en la revista Scientific Reports  Carolina Campos et al The frequency of defective genomes in Omicron differs from that of the Alpha, Beta and Delta variants. Sci Rep. 2022 Dec 29;12(1):22571. doi: 10.1038/s41598-022-24918-8. 

El posterior estudio con subvariantes de Omicron que han dominado la 7ª ola (BA.2, BA.5) revela un dato muy importante, y es que estas nuevas variantes vuelven a dejar de producir genomas defectivos, siguiendo el mismo patrón que se observó con el estudio de las variantes de 2020 y Alpha, Beta y Delta, demostrando que los genomas defectivos juegan un papel muy importante en la evolución del SARS-CoV-2.

El estudio ha sido financiado por la Dirección General de Investigación e Innovación en Salud (DGRIS) del Departament de Salut, el CIBER de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC) y el CIBER de Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBEREHD) del Instituto de Salud Carlos III, Gilead y el Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI) en colaboración con Roche Diagnostics.

 

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